...Выстраданные им и другими молодыми офицерами пожелания правительству-обратить внимание на одиноких,остающихся почти нищими после смерти сыновей-офицеров,русских матерей и увеличить им в пределах возможного пенсии- Марков направляет в письме в редакцию одной из газет.Строки о матери мы находим и в "Страничках из дневника" Маркова,рассказывающих о Всенощной в канун Рождества в 1-м Восточно-Сибирском стрелковом его Величества полку. Марков молился в церкви, в которую был превращён солдатский барак-столовая.С гаоляновыми стенами без окон,со скромным иконостасом,наполненная серыми солдатскими фигурами со свечами в руках, она казалась ему "какой-то пещерой первых веков христианства".Одна горячая молитва,молитва без слов,но понятная для всех...Марков перенёсся думами в Петербург и представил свою мать в церкви: "на коленях,сгорбленная,одинокая,до боли занкомая фигура.Чёрное траурное платье,мокрое от слёз лицо, заглушенные рыдания-вот молитва,вот слёзы войны...
Родная,не плачь,брат нашёл славную долю,верь в то,что я вернусь,верь в Того,Кто сохранит тебе последнего сына".
Это Рождество Марков встречал на позициях 1-го Сибирского армейского корпуса,в штаб которого он был переведён в декабре после расформирования Восточного отряда, и через некоторое время стал исполняющим обязанности старшего адъютанта штаба. Человек кипучей энергии и недюженных способностей, Марков и на этой должности сумел проявить себя. Вместе с войсками корпуса он участвовал во всех боях и походах с 7 декабря 1904 года. Январские бои под Сандепу(12-15 января 1905 года), марш-маневр вместе с корпусом в феврале 1905 года с правого фланга всех армий к левому и обратно к г.Мукдену, все дни Мукденских боёв - вот вехи его фронтовой биографии. Доблесть Сергея Леонидовича за период с 22 сентября 1904 года по 25 февраля 1905 года была отмечена четырьмя орденами : Святого Станислава 3-й степени с мечами и бантом, Святой Анны 3-й степени с мечами и бантом, Святого Станислава 2-й степени с мечами, Святого Владимира 4-й степени с мечами и бантом. В июне 1905 года он был Высочайшим приказом переведён в Генеральный штаб капитаном с назначением старшим адъютантом штаба 1-го Сибирского армейского корпуса.
По окончании войны,на основании опыта,вынесенного из неё,Марков пишет ряд обративших на себя внимание статей о боевой подготовке русской армии.Будучи прикомандирован к Лейб-гвардии Финляндскому полку и откомандовав один год 4-й ротой (прикомандирование это было засчитано ему за двухлетнее цензовое командование ротой) ,в январе 1907 года Марков назначается старшим адъютантом штаба 16-й пехотной дивизии, а с июня 1907 года по январь 1908 года он нёс службу помощником старшего адъютанта Варшавского военного округа. Затем в его карьере следует прикомандирование к Главному управлению Генерального штаба и назначение "исправляющим должность помощника делопроизводителя".В декабре 1909 года Марков был утверждён в этой должности и произведён в подполковники.Удачной военной карьере сопутствуют и счастливые события в личной жизни Сергея Леонидовича: женатый на княжне Марианне Павловне Путятиной , он обрадован рождением сына Леонида-в 1907 году,и дочери Марианны-в 1909 году.
В послужном списке Маркова есть сведения о его командировке в Германию с 3 мая по 3 августа 1910 года для усовершенствования знаний немецкого языка.Вероятно,к этому времени относится яркий эпизод из весьма спорных по своей информативности,"апокрифических" воспоминаний одного из юнкеров Владимирского военного училища в Петербурге, передающих обстоятельства выполнения Марковым секретного разведывательного задания по фотографированию усовершенствованных фортов немецкой крепости Торн.Заметив за собой слежку,Марков ,не теряя находчивости и присутствия духа,использовал единственное средство спасения-выгребную солдатскую яму,где просидел довольно длительное время,пока немцы не прекратили его поиски...
